Od 1 lipca 2016 r. duzi podatnicy mają obowiązek przekazywania do US co miesiąc danych w określonej strukturze: schemat_JPK_VAT(1)_V1–0.xsd, odpowiadającej pozycjom deklaracji VAT-7, VAT-7K oraz VAT-7D. Średni i mali podatnicy zostaną objęci tym obowiązkiem w 2017 roku. Celem wprowadzenia Jednolitego Pliku Kontrolnego jest zautomatyzowanie procesu kontroli organów podatkowych oraz skrócenie jej czasu. Stosowanie struktury JPK daje organom podatkowym pełny wgląd w księgi podatnika oraz dostęp do danych w formacie umożliwiającym ich dogłębną automatyczną analizę. Daje również możliwość prowadzenia kontroli w obszarach podatków VAT, PIT, CIT, w tym porównanie VAT i CIT. Obszar działania organu podatkowego może obejmować kontrole krzyżowe u kilku podatników, czynności sprawdzające oraz kontrole podatkowe w określonym zakresie.