Wprawdzie składanie wniosków o wydanie WIS jest możliwe już od wejścia nowych przepisów w życie,jednakże ochrona wynikająca z decyzji wydanych w okresie przejściowym – tj. od 1 listopada 2019 r.do 30 czerwca 2020 r. – jest skuteczna dopiero w stosunku do czynności (dostawy towarów i świadczenia usług) dokonanych po 30 czerwca 2020 r. Zatem dopiero od 1 lipca br. WIS wiąże organy podatkowe.