POLECAMY
Autor:
Wydawca:
Format:
epub, mobi, ibuk
Aktualne omówienie popularnych technik wykorzystywania danych molekularnych w badaniach ekologicznych
Książka ukazuje, jak biologia molekularna i genetyka populacyjna poszerzają naszą wiedzę na temat wybranych aspektów ekologii i ewolucji, takich jak lokalne przystosowanie, dyspersja w krajobrazie, filogeografia, ekologia behawioralna i biologia konserwatorska. Wraz z postępami technologicznymi w dziedzinie genetyki w szybkim tempie rozwija się innowacyjna dyscyplina ekologii molekularnej, dostarczająca nam istotnych informacji na temat niemal wszystkich grup taksonomicznych.
Najnowsze wydanie Ekologia molekularna prezentuje przełomowe osiągnięcia dokonane w tej dziedzinie wiedzy na przestrzeni ostatnich lat. Tym samym czytelnicy otrzymują do rąk wyczerpujące i aktualne omówienie obecnego stanu tej dyscypliny.
Do tematów, które niniejsze wydanie podejmuje po raz pierwszy, należą: sekwencjonowanie nowej generacji, metabarkodowanie, techniki związane z DNA środowiskowym (eDNA) oraz epigenetyka. Autorka książki, Joanna Freeland, jedna z czołowych badaczek w dziedzinie ekologii molekularnej, z myślą o osobach dopiero zapoznających się w tą dyscypliną badań omawia także podstawowe pojęcia i zasady stosowane w obszarze ekologii molekularnej.
Niniejszy podręcznik:
• jest przystępny i przyjazny czytelnikowi,
• stanowi wprowadzenie do ekologii molekularnej,
• został przejrzany w porównaniu z poprzednim wydaniem, dzięki czemu uwzględnia wyniki najnowszych badań i postępy w nauce,
• zawiera nowe rozdziały dotyczące kwestii takich, jak genetyka krajobrazu, metabarkodowanie czy genetyka zespołów.
Ekologia molekularna, zawierająca informacje, które przydadzą się każdemu czytelnikowi zainteresowanemu ekologią i ewolucją populacji żyjących na wolności, stanowi znakomity podręcznik także dla studentów i naukowców, którzy chcieliby dowiedzieć się więcej na temat tego fascynującego obszaru badań.
Rok wydania | 2021 |
---|---|
Liczba stron | 404 |
Kategoria | Ekologia i ochrona środowiska |
Wydawca | Wydawnictwo Naukowe PWN |
Tłumaczenie | Filip Fierek |
ISBN-13 | 978-83-01-21670-2 |
Numer wydania | 2 |
Język publikacji | polski |
Informacja o sprzedawcy | ePWN sp. z o.o. |
POLECAMY
Ciekawe propozycje
Spis treści
1. Genetyka molekularna w ekologii | 1 |
Czym jest ekologia molekularna? | 1 |
DNA, RNA i białka | 2 |
Allozymy | 5 |
DNA – niewyczerpane źródło informacji | 8 |
Mutacja i rekombinacja | 9 |
Znaczniki epigenetyczne | 11 |
Genomy | 13 |
DNA mitochondrialny (mtDNA) | 14 |
DNA chloroplastowy (cpDNA) | 15 |
Chromosomy haploidalne | 17 |
Reakcja łańcuchowa polimerazy | 19 |
Ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy | 20 |
Źródła DNA | 23 |
Pozyskiwanie danych metodą PCR | 24 |
Rozmiar fragmentów | 24 |
Sekwencjonowanie DNA | 27 |
Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe | 28 |
Podsumowanie | 31 |
Streszczenie rozdziału | 31 |
2. Markery molekularne w ekologii | 33 |
Zrozumieć markery molekularne | 33 |
Markery neutralne kontra markery adaptacyjne | 33 |
Genomy | 34 |
DNA mitochondrialny zwierząt (mtDNA) | 34 |
DNA mitochondrialny roślin (mtDNA) | 37 |
DNA chloroplastowy (cpDNA) | 38 |
Chromosomy haploidalne | 41 |
Markery jednorodzicielskie: zastrzeżenia końcowe | 42 |
Markery molekularne | 44 |
Wczesne fazy rozwoju markerów molekularnych | 44 |
Allozymy | 44 |
PCR-RFLP | 45 |
Losowo amplifikowany polimorficzny DNA (RAPD) | 46 |
Markery ISSR | 47 |
Polimorfizm długości amplifikowanych fragmentów (AFLP) | 47 |
Modyfikacja AFLP – polimorfizm wrażliwy na metylację (MSAP) | 49 |
Mikrosatelity | 50 |
Sekwencjonowanie DNA | 55 |
Sekwencjonowanie pojedynczego regionu DNA | 56 |
Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) | 57 |
Sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (HTS) | 61 |
Sekwencjonowanie RAD | 61 |
Genotypowanie przez sekwencjonowanie (GBS) | 63 |
Wychwytywanie sekwencji docelowej | 63 |
Sekwencjonowanie pełnogenomowe | 64 |
Podsumowanie | 65 |
Streszczenie rozdziału | 65 |
3. Gatunki | 67 |
Koncepcje gatunku | 67 |
Barkodowanie DNA | 69 |
Zastosowania barkodowania | 73 |
Barkodowanie i jego ograniczenia | 75 |
Metabarkodowanie | 80 |
Metagenomika | 82 |
Barkodowanie i metabarkodowanie eDNA (DNA środowiskowego) | 84 |
Podsumowanie | 89 |
Streszczenie rozdziału | 89 |
4. Filogeografia | 91 |
Czym jest filogeografia? | 91 |
Rozwój filogeograficznych zbiorów danych | 92 |
Zegary molekularne | 96 |
Drzewa dychotomiczne rozgałęzione | 98 |
Koalescencja | 106 |
Sieci | 108 |
Analizy filogeograficzne oparte na modelach | 111 |
Zmiany klimatyczne w długiej perspektywie | 112 |
Okresy lodowcowe i międzylodowcowe | 112 |
Ostoje morskie | 116 |
Długofalowe skutki zlodowaceń | 117 |
Dyspersja i wikariancja | 117 |
Sortowanie linii genetycznych | 120 |
Hybrydyzacja | 122 |
Filogeografia stosowana: inwazje | 126 |
Podsumowanie | 130 |
Streszczenie rozdziału | 130 |
5. Analiza genetyczna pojedynczych populacji | 132 |
Po co badać pojedynczą populację? | 132 |
Co to jest populacja? | 132 |
Obliczanie różnorodności genetycznej | 135 |
Równowaga Hardy’ego-Weinberga | 135 |
Wskaźniki różnorodności genetycznej | 141 |
Różnorodność haplotypowa | 145 |
Wybór markera i genomu | 145 |
Co wpływa na różnorodność genetyczną? | 147 |
Dryf genetyczny | 147 |
Co to jest efektywna wielkość populacji? | 148 |
Cenzusowa wielkość populacji (Nc) | 149 |
Efektywna liczba rozmnażających się osobników (Nb) | 149 |
Obliczanie Ne na podstawie danych demograficznych | 149 |
Obliczanie Ne na podstawie danych genetycznych | 151 |
Obliczanie Ne – zastrzeżenia | 157 |
Efektywna wielkość populacji, dryf genetyczny i różnorodność genetyczna | 157 |
Wąskie gardło i efekt założyciela | 159 |
Wielkość populacji i jej spadek | 161 |
Selekcja naturalna | 163 |
Rozmnażanie | 166 |
Chów wsobny (kojarzenie krewniacze) | 169 |
Ekologia i rozwój osobniczy | 172 |
Podsumowanie | 174 |
Streszczenie | 175 |
6. Dyspersja, przepływ genów i genetyka krajobrazowa | 177 |
Co to jest przepływ genów? | 177 |
Po co obliczać przepływ genów? | 179 |
Obliczanie przepływu genów między odrębnymi populacjami | 180 |
Statystyka F | 181 |
Testy przypisania | 184 |
Analiza pokrewieństwa i rodzicielstwa | 186 |
Identyfikacja populacji metodami nie a priori | 187 |
Genetyka i genomika krajobrazowa | 193 |
Analiza danych w genetyce krajobrazowej | 196 |
Izolacja przez dystans (IBD) | 197 |
Izolacja przez opór (IBR) | 199 |
Związki genotypu i środowiska | 200 |
Współczesne i historyczne czynniki wpływające na przepływ genów | 203 |
Zróżnicowanie populacji: przepływ genów, dryf genetyczny i przystosowanie | 205 |
Przepływ genów i dryf genetyczny | 205 |
Adaptacja lokalna i przepływ genów | 205 |
Dryf kontra selekcja | 208 |
QST i FST | 208 |
Podsumowanie | 210 |
Streszczenie | 211 |
7. Ekologia behawioralna | 212 |
Jak dane genetyczne pomagają zrozumieć zachowanie? | 212 |
Systemy rozrodcze | 213 |
Monogamia | 214 |
Poligamia | 214 |
Analiza rodzicielstwa | 216 |
Zapłodnienie pozapartnerskie | 219 |
EPF i dostosowanie samców | 221 |
EPF z perspektywy samicy – argumenty odwołujące się do adaptacji | 221 |
EPF z perspektywy samicy – argumenty nieodwołujące się do adaptacji | 222 |
Społeczne wychowywanie potomstwa | 229 |
Wychowywanie kooperacyjne – korzyści pośrednie | 230 |
Wychowywanie kooperacyjne – korzyści bezpośrednie | 234 |
Eusocjalność | 234 |
Dyspersja zależna od płci | 237 |
Dyspersja zależna od płci – analizy na poziomie populacji | 239 |
Genetyczne zróżnicowanie samców i samic | 239 |
Markery dziedziczone w różny sposób | 240 |
Pokrewieństwo | 244 |
Dyspersja zależna od płci – analizy na poziomie osobniczym | 244 |
Indeksy przypisania | 244 |
Autokorelacja przestrzenna | 246 |
Analiza rodzicielstwa | 248 |
Zgodność wyników | 248 |
Ekologia żerowania | 250 |
Podsumowanie | 255 |
Streszczenie | 255 |
8. Genetyka konserwatorska | 257 |
Taksonomia | 262 |
Podgatunki | 264 |
Taksony niższe niż podgatunek | 266 |
Jednostki ochrony i przystosowanie | 267 |
Różnorodność genetyczna | 269 |
Różnorodność genetyczna i potencjał ewolucyjny | 271 |
Transkryptomika i epigenetyka | 274 |
Różnorodność genetyczna a chów wsobny | 275 |
Depresja wsobna | 281 |
Selekcja oczyszczająca i selekcja równoważąca | 283 |
Pomiar depresji wsobnej | 286 |
Zróżnicowanie genetyczne i ratunek genetyczny | 289 |
Depresja outbredowa | 291 |
Reintrodukcje | 294 |
Hybrydyzacja | 297 |
Genetyka zespołów | 300 |
Podsumowanie | 304 |
Streszczenie | 304 |
Słownik | 306 |
Literatura | 322 |
Indeks | 390 |